nlme 相关问题

用于拟合非线性混合效应统计模型的R包。

r 替换 lme S4 对象中的部分字符串

这个问题是关于如何从S4 lme模型摘要对象中删除部分字符串。 假设这是我的模型。 # ----预备工作-------------------------------------------- ------------ 图书馆...

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nlminb 问题,收敛错误代码 = 1 消息 = 达到迭代极限但未收敛 (10)

我正在尝试使用 R 中的库(nlme)和 lme 函数找到适合我的数据的最佳模型。这是当斜率固定时我的模型: 固定绳长 <- lme(EnergyCost~ RopeLength, data = ...

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使用非线性混合效应模型 (nlme) 的预测变量进行预测的置信区间

我正在尝试使用 Ben Bolker 描述的 bootstrap 方法为非线性混合效应模型生成 95% 的置信区间。我可能误解了所使用的一些功能。我...

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nlme 中的多种随机效果

我需要在我的 lme 模型中再包含一个随机效应。然而,这两个随机效应不相关,因此不能嵌套。 我不确定如何为此编写代码。我已经尝试过

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如何在 nlme 与 lme4 中指定不同的随机效果?

我想使用 nlme::lme (底部的数据)在模型中指定不同的随机效应。随机效应是: 1) 截距和位置随主体而变化; 2) 截距随比较而变化...

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以混合模型方法分析这些数据的正确方法是什么?

我对完全随机区组设计中的浪费率进行了实验,并评估了多年来的土壤肥力和树木高度/直径。哪个型号最适合这个d...

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在R中使用lmer分析具有多个随机效应的混合模型?

重新编辑我之前的帖子。我尝试过交叉验证,但由于编码查询而被关闭。 我目前正在尝试寻找最佳方法来分析栖息地恢复治疗是否会产生影响

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如何在R中进行带有多个断点的分段线性混合回归?

我正在 R 中拟合分段线性混合回归。我知道我可以使用 nlme 包中的 lme,然后使用分段来执行分段线性混合回归。然而,读完后

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NLMIXR2:错误 - 无法计算出数字时间

我对基于模型的荟萃分析非常感兴趣,因此对非线性混合效应模型非常感兴趣。 我一直在 R 上使用库“nlmixr2”,但我一直在努力确定

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`purrr::map()` 适用于 `lmer()` 但不适用于 `lme()` 对象

使用 purrr::map() 运行 lmer() 分析时可以获得结果。但是当我想对 nmle::lme() 执行相同操作时,我收到了错误消息: `map()` 中的错误: ℹ 索引:1。 ℹ 姓名:p_h。 C...

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如何从“gls”对象中提取权重参数?

我正在使用 nlme 包创建广义最小二乘模型。这是一个带有生成数据集的可重现示例: # 加载必要的库 图书馆(nlme) # 生成一些数据 设置种子...

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在 Gamma GLMM 中处理空间自相关

问题概述 我正在使用一个数据集来检查植物生长与 各种因素,包括 14 个不同的海冰范围 (SeaIce) 采样点。为了分析数据,我...

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有没有办法创建一个循环,在其中提供函数和数据帧并对它进行子采样,然后使用子样本重复该函数 N 次?

我不确定正确的词是什么,所以很抱歉术语严重错误。基本上我有大约 1000 个数据点,我想随机对 100 个数据点进行子采样...

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如何将nlme摘要对象转换为表格

我有以下数据集 df3 = 结构(列表(A = c("51", "51", "51", "51", "51", "51", "51", “51”、“51”……

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如何将nlme对象转换为表格

我有以下数据集 df3 = 结构(列表(A = c("51", "51", "51", "51", "51", "51", "51", “51”、“51”……

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如何提取相当于lme4::VarCorr()的metafor::rma.mv(),用于具有随机斜率的多级混合效应元回归

我正在尝试使用与...类似的方法计算多级混合效应元回归的伪 R 平方,其中包括 metafor 包(即 rma.mv() 对象)中的随机斜率

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如何在 R 中使用 nlme 设置每组的 phi?

当使用fixed = TRUE将值指定为phi时,如何为每个主题设置固定值(例如主题1的值= 0.7,主题2的值= 0.5等)? 图书馆(nlme) 模组 <- gls(rate ~

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使用 mitml、nlme 和 geepack R 包进行多重插补后获取估计平均值

我正在通过 mitml 包(使用 panimpute() 函数)运行多级多重插补,并通过 nlme 和 geepack 包拟合线性混合模型和边际模型...

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lme() 函数中截距的两个随机效应

我正在尝试使用 nlme 包中的 lme() 函数将两个随机效应引入到截距中。这个想法是在 nlme() 中重写 barleyprogeny1.lmer 模型。 我找到了一些资料...

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NLME 函数中的错误:第 0 级、第 1 块的反求解中存在奇异性

我正在尝试使用 nlme 函数将 ELISA 板数据拟合到非线性混合效应模型。之前,我询问过如何使语法适用于嵌套组,尽管回复让它看到......

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