OpenMP是一种跨平台的多线程API,它允许使用特殊的编译器指令进行细粒度的任务并行化和同步。
我有一个迭代求解器,可以求解某种偏微分方程(例如泊松方程),并且需要多次迭代才能收敛到正确的解。我的代码中的这个函数需要很大的时间...
如何使用 OpenMP 并行化 COO 格式的稀疏矩阵-矩阵 (SpMM) 乘积?
我最近使用 COO 存储格式编写了稀疏矩阵向量 (SpMV) 产品的多线程版本: void dcoomv(SparseMatrixCOO *A, 双 *x, 双 *y) { 对于 (int i=0; im;...
MacOS 编译出现 clang 错误:错误:不支持的选项 '-fopenmp'
我在 MacOS Ventura 13.4.1 上安装 IpOPT 时遇到错误。 我按照 Ipopt 安装说明中的说明进行了 ./configure 并尝试通过以下方式进行编译: 制作 但是,出现以下错误
当将内部过程作为参数传递时,Ifort 在 OpenMP 并行代码中给出段错误,但 gfortran 则不然
我制作了一个更复杂的 Fortran 代码的最小示例,在使用英特尔 Fortran 编译器 ifort 而不是使用 GNU 编译器 gfortran 编译和运行时出现分段错误......
Ifort 在访问共享变量时会在 OpenMP 并行化代码中出现段错误,但 gfortran 不会出现
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我需要知道我的应用程序通过 OpenMP 生成的线程总数。不幸的是, omp_get_num_threads() 函数在这里不起作用,因为它只产生线程数......
我正在为 CSC 存储格式开发自己的稀疏 BLAS 函数实现。为此,我创建了以下数据结构: typedef 结构 SparseMatrixCSC { 整数米; // 数量...
我正在尝试学习如何在 OpenMP 中使用归约,并且想知道是否可以使用归约来重写以下示例? 示例 A:求三个矩阵/张量的和 #包括<...
为每个 OpenMP 线程预分配内存以避免循环内重复堆分配的最佳方法是什么?
我有一个并行的 for 循环,如下所示: #pragma omp 并行 for 对于 (int i = 0;i 我有一个并行的 for 循环,如下所示: #pragma omp parallel for for (int i = 0;i<N;i++) { InnerFunction(); } 问题在于 InnerFunction 需要利用堆内存数据容器(例如向量)并动态调整其大小。即,InnerFunction 看起来像这样: void InnerFunction() { vector<double> vec; //and then vec is subsequently resized as part of the function operation, which is being omitted here for brevity } InnerFunction 事先并不知道向量需要变成多大,这就是它不能使用 std::array 的原因。 根据测试,我认为该函数遇到性能问题(即速度变慢),因为内部循环不断分配和释放堆内存。 因此,我重写了函数来执行此操作: vector<vector<double>> outervec; outervec.resize(omp_get_max_threads()); #pragma omp parallel for for (int i = 0;i<N;i++) { InnerFunction(outervec[omp_get_thread_num()]); } void InnerFunction(vector<double> &vec) { vec.clear(); //and then vec is subsequently resized as part of the function operation, which is being omitted here for brevity } 这是有效的,因为 vec.clear() 不会释放堆内存。因此,在函数的大多数运行中,InnerFunction 可以利用先前分配的堆内存,而无需任何新的内存分配或释放。 我的实施是实现我的目标的“正确”方式吗?是否有“最佳实践”方法来做到这一点,或者 OpenMP 内置的东西?看来我的实现有效(即,它没有崩溃),但我不确定是否:(a)它是最有效的(即,在内部循环中多次运行 omp_get_thread_num 是否会产生有意义的开销,如果是这样,这可以吗?可以避免吗?),(b)是否存在我所遗漏的任何潜在的线程安全问题,以及(c)是否有更好的编码“风格”实现必须依赖于使用 omp_get_thread_num 调用? 直观上,这种情况对于 OpenMP 实现来说应该相当常见,我想知道 OpenMP 是否有内置的东西来促进它。 使用 outervec 来为每个线程保存单独的向量并将适当的向量引用传输到 InnerFunction 的实现是实现此目标的有效方法。但是,有一些注意事项和潜在的增强功能需要注意: omp_get_thread_num() 的开销: 在内部循环中调用 omp_get_thread_num() 可能会带来一些开销,特别是当循环很小并且获取线程编号的成本相对于 InnerFunction 执行的计算而言变得很大时。一种可能的优化是将线程号缓存在循环外并在循环内使用。 int num_threads = omp_get_max_threads(); vector<vector<double>> outervec(num_threads); #pragma omp parallel { int tid = omp_get_thread_num(); vector<double>& vec = outervec[tid]; #pragma omp for for (int i = 0; i < N; i++) { InnerFunction(vec); } } 这样,每个线程只需调用 omp_get_thread_num() 一次,然后在循环内重用线程特定的向量。 线程安全问题:只要每个线程都在其自己的单独向量上工作(即,多个线程不会对同一向量进行并发修改),您的实现就应该是线程安全的。由于每个线程都有自己的 vector<double>,因此在这种特定情况下不应该出现数据争用或线程安全问题。 替代内存管理:您可以考虑使用内存池或自定义分配器来更有效地管理向量的内存,而不是使用向量的向量。内存池是您自己管理的预先分配的内存块,您可以使用它在 InnerFunction 内根据需要分配和释放内存。这样,您就可以避免频繁调用系统堆,从而可以显着提高性能。 使用 OpenMP Threadprivate 进行线程私有存储:OpenMP 提供 threadprivate 指令,它允许您指定每个线程本地的线程私有变量。您可以使用此指令将 vector<double> 声明为线程私有,然后直接在 InnerFunction 中使用它,而不将其作为参数传递。 #pragma omp threadprivate(vec) #pragma omp parallel for for (int i = 0; i < N; i++) { InnerFunction(); } 通过这种方法,每个线程都将拥有自己的 vec 的私有副本,并且您不需要将其作为参数传递给 InnerFunction。请注意,threadprivate 变量应在全局范围内或在 parallel 区域内声明。
我正在尝试使用 C++ 中的 OpenMP 来提高稀疏矩阵向量乘积的性能。我以 COO 格式存储稀疏矩阵,也就是说,我有一个由 3 个数组组成的结构,分别对应于每个
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我正在测试这个算法(Gridpoint Statistical Interpolation,已终止支持)并一直在关注其在线教程,特别是案例 9。作为该算法的一种总结...
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我编写了一个每秒需要创建数百万个对象的应用程序。我发现内存分配对性能有很大的影响。所以我想写自己的回忆
如何使用 scons 使用 openmp 正确编译 Fortran 程序?
免责声明:我是 openmp 的新手。最初,我以为我在 openmp 中做错了(可能仍然是这种情况),但现在问题似乎与我如何使用 openmp 进行编译有关...