slurm 相关问题

SLURM是一个开源资源管理器，专为各种规模的Linux集群而设计。

如何执行matlab函数并将输出保存在linux中的新文件中？

这是我第一次使用matlab脚本。我有一个带有一些输入文件和matlab脚本的文件夹“example”。它看起来如下：例如├──input.score├──input.param├──输入....

linux bash matlab shell slurm

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提交后在Slurm中添加Job Array元素

我正在尝试使用Slurm操作的集群来运行LS-Dyna（一种有限元模拟程序，我的集群上有许多可用的许可证）。我正在尝试编写我的批处理脚本，以便...

bash slurm

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解决SLURM“sbatch：错误：批处理作业提交失败：请求的节点配置不可用”错误

我们的本地集群有4个GPU节点，2个36核CPU和200 GB RAM。当我尝试使用以下配置提交作业时：#SBATCH --nodes = 1 #SBATCH --ntasks = 40＃...

cluster-computing batch-processing slurm

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在多个节点上使用srun运行mpirun会产生不同的通信器

我正在使用Here中的hello world示例，其中每个进程都打印其进程名称及其MPI_COMM_WORLD排名id和通信器大小。＃包括＃包括

mpi slurm

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slurmd无法与slurmctld沟通

我按照以下步骤进行故障排除：https：//slurm.schedmd.com/troubleshoot.html。当运行scontrol show slurmd时，我得到：活动步数=无实际CPU = 1实际...

slurm

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Python：集群作业管理

我在计算集群（slurm）上运行python脚本，有两个阶段，它们是顺序的。我写了两个python脚本，一个用于Stage 1，另一个用于Stage 2.每天早上我检查是否所有...

python cluster-computing slurm

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SLURM：更改正在运行的阵列作业的最大同时运行任务数

我有一个数组作业的设置如下：sbatch --array = 1：100％5 ...这将限制同时运行的任务的数量为5.作业现在正在运行，我想将此数字更改为...

slurm sbatch

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致命的Python错误：initfsencoding：无法获取语言环境编码文件“/cm/shared/apps/anaconda2/4.5.12/lib/python2.7/encodings/__init__.py”

我正在为SLURM工作负载管理器编写作业提交脚本。首先，我已经加载了anaconda2 / 4.5.12（包括python 2.7）模块。然后，我用Python3.7版本创建了conda环境。一世 ...

python slurm

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我怎么能在Slurm下运行Open MPI

我无法通过Slurm脚本在Slurm下运行Open MPI。通常，我可以获取主机名并在我的机器上运行Open MPI。 $ mpirun hostname myHost $ cd NPB3.3-SER / && make ...

openmpi slurm sbatch

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slurm：即使在崩溃的作业重新排队后，DependencyNeverSatisfied错误

我的目标是使用slurm依赖项构建一个管道，并处理一个slurm作业崩溃的情况。根据以下答案和指南第29节，建议使用scontrol requeue $ jobID，...

slurm

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什么是HPC内核（MPI-OpenMP）？

用简单的语言，什么是内核及其用途？我见过并行化代码，如：＃！/ bin / bash #SBATCH --job-name = bt-mz #SBATCH --output = bt-mz_％j.out #SBATCH --error = bt-mz_％j。 ...

parallel-processing mpi openmp cluster-computing slurm

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根据sacct数据选择slurm作业

在使用slurm的集群上，我正在尝试创建在特定时间间隔内提交的作业列表，以便我可以取消它们。手工我可以使用：sacct --format =“JobID，Submit”......

linux awk hpc slurm

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因为停留时间（SLURM）而上次被杀的时候开始工作

我正在使用SLURM的机器上运行模拟。我可以设置的最长墙壁时间是24小时，但我的模拟需要更长的时间（大约1周左右）。我知道原则上我可以......

slurm

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slurm python多处理超出内存限制

我在python中的多处理代码完全适用于我的计算机。但是当我使用slurm时，我得到一个Exceed作业内存错误。我无法弄清楚如何解决这个问题。在这个链接@jaap建议......

python memory-management memory-leaks multiprocessing slurm

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如何使用许多工作人员发送slurm作业而不仅仅是在本地模式下运行？

我想使用命令srun和sbatch在slurm集群上使用命令spark-submit运行python脚本。当我运行当前脚本时，它会一直运行，直到结束和结束状态为COMPLETED。 ...

python apache-spark pyspark cluster-computing slurm

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HPC群集：选择SLURM sbatch中的CPU和线程数

sbatch手册页中使用的术语可能有点令人困惑。因此，我想确保我正确设置选项。假设我有一个任务在一个有N个线程的节点上运行。我......

multithreading parallel-processing mpi hpc slurm

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如何使用命令行中的rscript命令在R中运行作业数组？ [关闭]

我想知道如何使用Rscript函数在R中运行500个并行作业。我目前有一个R文件，顶部有标题：args

r parameter-passing cluster-computing hpc slurm

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SLURM：查看每个节点有多少个核心，以及每个作业的核心数

我搜索过谷歌并阅读文档。我的本地群集正在使用SLURM。我想检查以下内容：每个节点有多少个核心？队列中的每个作业有多少个核心......

slurm

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使用Joblib + Dask将许多子进程派生到HPC上的许多不同节点

我正在尝试运行一个python程序，它曾经执行过很多（数千个）令人尴尬的并行进程，这些进程是以对其他软件的子进程调用的形式进行的。我正在运行这个......

python-2.7 cluster-computing dask slurm joblib

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如何在qos上使用maxTRESperuser为slurm设置每个用户的cpu限制

我只是将qos参数MaxTRESperuser设置为cpu = 10用于测试目的，但是slurm是schedulling job。我用过：sacctmgr修改qos正常设置maxtresperuser = cpu = 1我们可以查看sacctmgr ...

slurm

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