cluster-analysis 相关问题

聚类分析是将“相似”对象分组为称为“聚类”的组的过程,以及对这些结果的分析。

使用从 finch-clust 库导入的 FINCH() 进行聚类时出现类型错误

将 numpy 导入为 np 从sklearn导入数据集 将 matplotlib.pyplot 导入为 plt 从芬奇导入芬奇 n_样本 = 5000 n_簇 = 5 随机状态 = 42 X, y = datasets.make_blobs(n_samples=n_sa...

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不同长度序列列表的分析

我有1000个列表如下: [[6,7,7,5,5,5,7,6,7,5,6,5], [7,7,7,5,5,6,6,7,7,7,7,6,5], [7, 7, 5, 6, 6, 5, 5, 7, 6, 6, 6, 5, 7, 5], [6,5,7,7,6,5,7,5,7,6,...

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查找重叠列表组

我有这样的列表数据的分类列表: df=pd.DataFrame({'ID':['A','B','C','D','E','F'],'目标':[[x,y],[m ,n],[x,k],[x,k,y],[m],[p,h]]) |身份证 |目的地 | | -------- | -------- | |...

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Python:基于可能季节性数据的聚类模型

我有一个如下所示的数据集: ID 年月 X1 1 2021-01 100 1 2021-02 200 1 2021-03 12 2 2021 年 1 月 150 2 2021-03 10 数据可能是季节性的;十二月/一月/二月和七月/八月/九月 I

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如何在Cytoscape中制作没有边缘的聚类图?

我是 Cytoscape 的新手,想要可视化类似于下图所示的聚类图。 在此输入图像描述 但是,我还没有找到办法做到这一点。请帮助我克服这个问题

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在 R 中的 t-SNE 之后应用聚类算法

所以我正在做我的学士工作,我正在对某些数据应用不同的聚类算法。当然,在所有聚类之前,我使用降维算法,例如 t-SNE

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如何解释 kmodes、Python 中 K 原型的成本?

我正在Python中使用kmodes.kprototypes对混合(数字和分类)类型数据进行聚类: 从 kmodes.kprototypes 导入 KPrototypes kp = KPrototypes(n_clusters=5, init='曹') kp.fi...

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保持给定的一组对分离的聚类算法

我有一个聚类问题,我必须将一组 S 样本分成 C 个簇,其中 C 是已知的。通常,我可以使用简单的 KMeans 聚类来执行聚类操作,wh...

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根据 R 中的聚类分析创建气泡图(或类似的东西)

以下数据框是聚类分析结果的示例,我想创建可视化效果。我正在考虑考虑列总数的气泡图,但是......

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Python scipy/numpy 中相关性的层次聚类?

如何在 scipy/numpy 中的相关矩阵上运行层次聚类?我有一个 100 行 x 9 列的矩阵,我想根据每个条目的相关性进行分层聚类...

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如何使用sklearn指定聚合聚类的内存目录

我正在尝试使用 sklearn 的 AgglomerativeClustering 来优化用于在同一数据集上计算具有不同数量的集群的多个结果的计算时间。 如 s 中所示...

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将行簇应用于新矩阵时,R ComplexHeatmap 无法重现精确的行顺序

我首先在 ComplexHeatmap 中使用 k-means 方法对矩阵的行进行聚类,然后将聚类应用到具有相同维度的新矩阵上,并且我预计我可以在...

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根据常见子模式对短的同质字符串(DNA)进行聚类并提取类的共识

任务: 将大量短 DNA 片段聚类到共享共同子序列模式的类别中,并找到每个类别的共有序列。 泳池:约。 300 个序列片段 8 - 20 让...

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K-means 递归:ConvergenceWarning:发现的不同簇数 (5) 小于 n_clusters (6)。可能是由于 X 中的重复点

我编写了一个Python脚本来使用聚类(K-means)获得TSP的解决方案。原理是创建集群并获取每个集群之间的最佳路径(使用它们的质心)。那么,对于...

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根据局部线性度分割一组点的分割算法

假设我有一些点,大致由 N 段组成,每个段之间都有一定的线性关系。下面的例子显示了3个簇,但一般我们不知道有多少个segm...

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使用 k 均值聚类在两个 Igraph 图之间通过颜色指示相同的聚类

我有来自两个不同数据集的两个邻接矩阵,它们具有相同的变量: 阿玛特<- read.table(text = " Si N1 N2 A1 A2 A3 A4 A5 Z1 Z2 Z3 Z5 Si 367 0 0 48 0 365 ...

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K-Means 聚类中距质心最近的 M 个点

我实现了一个函数,用于查找运行 K-Means 聚类算法后计算出的每个质心最近的数据点。我想知道是否有一个 sklearn 函数可以让我...

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内核自组织映射(SOM)中的归一化获胜频率是什么?

在 MacDonald 和 Fyfe (2000) 提出的基于 k 均值的内核 SOM 中,均值的更新基于软学习算法 mi(t + 1) = mi(t) + Λ[φ(x) − mi(t)] 其中 Λ 是归一化的 wi...

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识别受边缘属性约束的连接子网

我正在处理网络数据,想要识别连接的子网。我使用加载数据 图 <- graph_from_data_frame(filtered_df, directed = FALSE) and ploted my network plot(graph) E(

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在 scikit-learn 的凝聚聚类算法中,如何获得所有中间簇?

我正在运行这个相对简单的算法。 如果我正确地理解了算法,如果你聚类到 8 个簇,那么你应该得到 8 个以上的所有簇的结果,对吧? 会...

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