hierarchical-clustering 相关问题

分层聚类是一种聚类技术,可在多个层级生成聚类,从而生成聚类树。分层聚类为具有可视化潜力的分析师提供了优势。

无法在 "dbscan "包中的hdbscan函数下预测新点的簇成员资格。

我正在使用名为 "dbscan "的软件包下的hdbscan函数对一个数据进行聚类。我无法在建立聚类后预测一个新数据点的成员资格。预测 ...

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在由数千种相关矩阵组成的字典中进行有效计算。

基于20种资产的每日观测数据集,我创建了一个由(滚动)相关矩阵组成的字典。我使用日期指数作为字典的关键。我...

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警告:python中的非压缩距离矩阵。

我试着做一个Dendrogram关联的聚集层级聚类,我需要距离矩阵。我开始用: import numpy as np import pandas as pd from scipy import ndimage ...。

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Python scipy聚类不能正常工作

我有一堆2D中的点(x的行),想把它们聚在一起,使每个簇的直径< d(我事先不知道簇的数量或大小)。如果我使用完全链接, ...

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R - 如何从异质矩阵中找到最近的邻域?

我有一个异同矩阵(gower.dist),现在我想找到离某个数据点(例如第50行)最近的n个邻居。谁能帮帮我?样本数据 https:/...。

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我怎么理解在树状图分层群集中显示了多少群集?

我正在为Aggregatemative Hierarchical集群工作。我找到了输出图。但是我不明白从该图中可以接受多少聚类。如何计算群集数?我的...

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比较具有基本事实的聚类

我在比较我的HAC聚类结果和手工标记文档的真实性时遇到问题。整个数据集由9k个文档组成,而真实数据则为100个; ...

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在heatmap和heatmaply R软件包中进行聚类

我正在使用R heatmaply包来生成交互式热图。我喜欢该软件,但是我想从中获得与使用pheatmap相同的聚类(行和列的顺序)...

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按组划分的齿形图着色

[我根据spearman的相关矩阵创建了一个热图,并使用了Seaborn簇图,如下所示:sns.set(font_scale = 1)g = sns.clustermap(df,cmap =“ bwr”,vmin = -1,vmax = 1,.. 。

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OPTICS算法中的密度连通集

我对OPTICS算法感到困惑。如果一组点是密度连接的,则可以将它们视为一个群集。如果存在对象o,使得...

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如何在Seaborn / Matplotlib上获得带注释的热图/集群图?

我正在处理一堆患者的肿瘤图像表达数据,对于每个患者,我都有其肿瘤的提取图像特征列表。我使用...

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为什么scipy.cluster.hierarchy.linkage需要度量?

我们需要传递距离矩阵,因此不需要计算任何其他距离,对吗?我想念什么?此处的文档:http://docs.scipy.org/doc/scipy-0.14.0 / ...

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Python scipy的树状图/链接的交换叶子

我为我的数据集生成了一个树状图,但我不满意如何在某些级别对拆分进行排序。因此,我正在寻找一种交换单个拆分的两个分支(或叶子)的方法。如果...

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Python中没有包的分层聚类

我正在尝试使用python查看/编写用于分层集群的代码。但是,在我看来,到处都在使用软件包或库,例如scikit-learn。我想看一下...

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分层聚类-在每个组中找到观测值

我拥有大量数据,且协变量超过10个。目前,我正在使用分层群集。在树状图上,我看不清标签,因为标签太多了。 -是否有...

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要使用python确定给定数据集的最佳k均值

我对python和杂乱无章的东西很陌生。现在,我的任务是分析一组数据,并使用弯头和轮廓法确定最佳Kmean。如图所示,我的...

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我如何找出有损失的样本数量>中位数损失;和使用R

我如何找出损失的样本数>损失中位数;以及使用R中的层次聚类造成的损失。我正在使用数据集Allstate声明严重性,我认为数字...

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在R中的一个城市中对长/时热点区域进行聚类的最佳方法?

我是R和(无监督)机器学习的新手。我正在尝试为R中的数据找到最佳的群集解决方案。我的数据是关于什么的?我有一个+/- 800长/纬度WGS84的数据集...

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具有层次聚类的颜色的图聚类

#绘制图形plt.figure(1); plt.clf(); plt.scatter(data [0,:],data [1 ,:]); plt.xlabel('x'); plt.ylabel('y'); plt.title(“来自CURE数据集的所有点的图”)#进行树状图Y = pdist(data,'...

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具有可绘制的树状图-如何为分层聚类设置自定义链接方法

我是新手,需要绘制具有组平均链接的树状图。我知道在create_dendrogram()中有一个distfun参数,但是我不知道该如何传递给...

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