分层聚类是一种聚类技术,可在多个层级生成聚类,从而生成聚类树。分层聚类为具有可视化潜力的分析师提供了优势。
对于 R 中的树状图,如何在根据簇为分支着色的同时添加自定义文本?
我有这个树状图: 碳氢化合物<- hclust(dist_s, method = 'average') At first, I was showing it with dendextend: dend = as.dendrogram(hc) par(mar = c(3, 2, 2, 8)) dend %>% 设置(“labels_ce ...
我想从sql server数据库中的表中提取层次结构。表格看起来与此类似,等级达到 10 级: 1级 lvl2 3级 我想提取一个层次结构...
我想从sql server数据库中的表中提取层次结构。表格看起来与此类似,等级达到 10 级: 1级 lvl2 3级 我想提取一个层次结构...
我正在从事一个 ML 项目,但在解决该问题时陷入困境: 我有一个表(.csv 文件),其中包含我所有名为 BAM_xxxx 的 .txt 文件的列“文件”列表,...
层次聚类,距离度量问题(Pearson、Manhattan、Euclidean)
我正面临这个奇怪的问题,我无法弄清楚。对于欧几里德距离和曼哈顿距离(无论是否标准化),聚类的划分方式非常奇怪。 我
我正在寻找使用 R 绘制一个看起来像层次聚类树(树状图)的图形,除了我的情况,我已经知道哪些集群与哪些集群合并。 示例:假设我们有对象...
我面临这个问题:通过单一、完整和平均的链接,我得到一个由所有实例组成的集群。我举个例子: 计算 2 个集群: 集群 1. 4599 个观测值 集群...
我正在尝试开发一个预测房价的模型。该模型的输入之一是给定邮政编码中的中位数和平均价格。这种方法的问题是在同一个位置...
Preparing non-equal length or sample freq time series for dtwclust
寻求帮助,了解如何准备多个不同长度(和采样频率)的时间序列,以便使用 R 中的 dtwclust 包进行聚类。请注意,我的系列是在 15 或 30 分钟 sa...
我有一个数据框,其中包含代表不同患者的行,并且在列中可以更改所有可能的基因,每个列的值如果没有突变则为 0,如果突变则为 1,索引...
我对使用自定义距离函数计算距离矩阵很感兴趣。此功能应考虑空间数据和两个控制变量。这个距离可以是欧几里得。侦探...
我正在尝试使用不同的聚类技术在 Python 中对时间序列数据进行聚类。 K-means 没有给出好的结果。以下图像是我使用凝聚
我正在使用 pvclust 对我采样的不同位置进行一些层次聚类分析。虽然初级抽样单位始终相同,但由于后勤原因,存在不同的...
在Python中使用值阈值从矩阵中定义聚类,并通过聚类大小命名。
我有一个样本间的对差矩阵。我想把每个样本标记为一个簇的一部分,用簇的大小来命名,其中簇是由一个绝对的截止点来定义的。
我用Scipy创建了下面的树状图。我用Levenshtein距离用scipy.spatial.distance.pdist创建了一个距离矩阵 然后我用scipy.cluster......创建了一个聚类。
我正在处理一个DTM,我想做k-means、heirarchical和k-medoids聚类。我是不是应该先对DTM进行标准化?
数据,AllBooks有590个观测值8266个变量。下面是我的代码。AllBooks = read_csv("AllBooks_baseline_DTM_Unlabelled.csv") dtms = as.矩阵(AllBooks) dtms_freq = as.矩阵(...)
我在clusim (python)的文档中看到以下内容 从clusim.clustering import Clustering, print_clustering import clusim.sim as sim c1 = Clustering(elm2clu_dict = {0:[0], 1:[0], 2:[1], 3:[1], 4:...)
我有很多vecmath点对象(Point3d FWIM),我想根据它们之间的距离进行 "分组"。我大概可以从头开始写代码(我在......中完成过类似的任务)。
我使用R的时间不长。我用的是R 3.4.4。对于一项研究,我创建了如下集群: library('cluster') clusterward2。
我无法从scipy树枝图字典中得到色叶。正如文档和这个github问题中所说,dendrogram字典中的color_list键指的是链接,而不是 ...