lme4 相关问题

lme4是一个R包,用于拟合和分析线性,非线性和广义线性混合模型。

使用 sJplot::plot_model 绘制多个交互图以获得多个结果

我想使用 sjPlot::plot_model 从多个结果数据生成多个交互图。 例如,我正在使用 nlme 的数据集 MathAchive 并加载这些包 图书馆(nlme) 图书馆...

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为什么 sjPlot 的 tab_model() 和 Anova() 的 p 值与 LMM 输出不匹配?

我有一个关于 lme4 LMM 模型输出的 p 值估计的问题: 我比较了函数 tab_model 和 Anova 生成的 p 值,它们似乎不匹配。当我运行方差分析时,我得到

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lmer 中使用的 b 样条出现错误“derivs 大于 x 的长度”

我使用Rstudio。根据 https://stats.stackexchange.com/questions/135694/using-b-splines-within-a-linear-mixed-effects-model-in-r 我想将所谓的 b-splines 添加到我的型号: 德...

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无法从 OpenSUSE Leap 15.2 安装 arm 和 lme4 软件包

我使用的是 OpenSUSE Leap 15.2 操作系统以及预装的 R v3.5.0。除了 rstudio 之外,我不需要安装任何软件包。 以下是安装详细信息: > 会话信息() R版本...

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如何获取混合效应模型中的系数及其置信区间?

在 lm 和 glm 模型中,我使用函数 coef 和 confint 来实现目标: m = lm(resp ~ 0 + var1 + var1:var2) # var1 分类,var2 连续 系数(m) 限制(m) 现在我添加了随机效果...

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使用库 mouse() 中的估算数据集来拟合 R 中的多级模型

我是在 R 中打包小鼠的新手。但我试图从 popmis 中估算 5 个数据集,然后用每个数据集拟合一个 lmer() 模型,最后用 pool() 拟合它们。 我认为 mouse() 中的 pool() 函数不会...

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将相同的 glmer 模型拟合到相同数据的多个子集

我试图解决与这篇文章中基本相同的问题,但我似乎无法将其应用于 glmer 而不是 lmer。 我有一个相当复杂的模型,看起来像这样: 模组 1 <-

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等式:lmer 模型“下标越界”

我正在尝试使用等式包来绘制我的 lmer 模型。 c1<-lmer(sqrt(co22)~t.air+t.soil+tdr+ph+TC+TN+wtd+Fe+0+(1|treatment/site), data=data) However, when trying to extract the equation, I...

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使用 R 中的 glm 函数将对数正态分布应用于我的数据

我想对具有特定类型分布的数据实现混合效应模型。这是我的名为“a”的数据的示例: 输出(头(a)) 结构(列表(pNum = c(1L,1L,1L,1L,1L,1L),

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三级部分嵌套模型

我正在使用 R 和 lme4 对团体心理治疗受试者随时间的变化进行建模。 我的数据具有以下结构: 主题(ID) 时间(代码 1-10 表示等间隔重复小节) 结果(对于

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R 中的约束基线纵向模型

我有一个随机对照试验的纵向数据集,其中有两个臂(arm),以及在三个时间点(周期)评估的结果(Y)。第一个周期为 0,是基线...

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使用 lme4 分析时间序列数据时,如何同时包含阶跃变化和斜率变化?

我有一些时间序列数据,包括四个不同的位置。在某个时间点有干预(每个地点不同)。 d <- structure(list(location = c(1L, 1L, 1L, 1L...

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如何在 nlme 与 lme4 中指定不同的随机效果?

我想使用 nlme::lme (底部的数据)在模型中指定不同的随机效应。随机效应是: 1) 截距和位置随主体而变化; 2) 截距随比较而变化...

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从线性混合模型(lme4)获取效应大小

假设我想获得 lmer 对象中每个项的某种效果大小,最好的方法是什么?例如,我的模型有两个主要效应(基因和营养物)以及它们之间的关系...

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plot_model 的默认误差间隔是多少?

我正在使用 sjPlot::plot_model 来绘制 lmer 模型。默认误差线是多少? 这是我的模型: <- lmer(dv~iv1+ factor(iv2)+ (1+iv1+factor(iv2)|subject)) Here is the plot model with no

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如何使用 R 中的 nlmer 函数拟合具有随机效应的 Michaelis-Menten 模型?

我们希望将 Michaelis-Menten 函数拟合到数据集,其中“CTIR”是响应变量(对应于饲喂率),“FL”是自变量(对应...

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Matrix 包中的lmer

我对 lmer 和 glmer 函数有疑问。当我使用函数时出现错误: 初始化 Ptr() 时出错: 包“Matrix”未提供函数“cholmod_factor_ldetA” W...

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将线性混合模型拟合到非常大的数据集

我想对以下格式的 60M 观测值运行混合模型(使用 lme4::lmer);除了连续因变量之外,所有预测变量/因变量都是分类变量...

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lmeR 模型中的 SK 测试:XXlist[[ii]] 中出现错误 <- XX : attempt to select less than one element in integerOneIndex

我正在尝试在 lmer 模型中进行苏格兰结测试,我想要 Prov 均值排名! 我应该在which=中放入什么? lmer1 <- with(inDB, lmer(stVOL8 ~ Rep + (1|Prov), data=inDB)) sk2 <- SK(l...

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如何在 R 中分割和修改多重混合效应模型的点图

我在 R 4.3.1 中有以下脚本,这不是完整的脚本,而只是相关部分: 图书馆(lme4) 库(lmerTest) 库(ggplot2) 库(格子) 库(RColorBrewer) MEDE.fin ...

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