vegan 相关问题

素食主义者是与R一起用于分析生态群落,特别是植被群落的一揽子计划。它具有分析生态多样性和社区多变量分析的工具(NMDS,pCCA,pRDA等)

安装纯素包装时存在置换和格子的问题

我正在尝试做家庭作业,但是被卡住了。请帮忙!我已经安装了“ permute”和“ lattice”……但是它仍然无法正常工作。我该怎么办?

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['vegan软件包”是由内部版本不同的R版本安装的]]

我已经为Windows(32/64位)和RStudio 1.1.442安装了R-3.4.4-Windows Vista / 7/8/10。我安装了素食主义者2.4-6软件包。当我尝试打开它时,我收到以下消息:> install.packages(“ C:...

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如何绘制在R(素食主义者包)一个NMDS情节不同颜色的网站?

我从草原(场1-14)和采石场(15-28位)的网站数据,并希望他们有不同的颜色中,我和素食套餐,e中创建我的NMDS情节。 G。网站数1-14红...

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如何着色的因素在素食主义者的rarecurve线?

即时试图绘制每个我的20个样品的稀疏曲线 - 并且通过使用素食R. rarecurve我已分组的列在一起是各自的治疗类型(5)的彩色线...

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R-包装的素食主义者Decorana

输入图像描述hereI'm新R和我试图运行趋势对应分析法(DCA),这是种协调多元统计分析,我有四点。一世 ...

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整理NMDS排序图

我有来自采石场和石灰质草原地点的繁殖鸟类组合数据,并希望将它们与环境参数作为载体一起显示在nmd ordination图中。我怎么能够 ...

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定制素食主义者

我有一个包含100种物种的数据集,因此绘制非常糟糕。所以我想挑选出这些物种的一个子集并将它们绘制在RDA图中。我一直在遵循这个准则代码......

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在R中进行子集化后,“X”必须是Decorana / VEGAN函数中的数字错误

我一直收到这个错误:rowSums(veg)出错:'x'必须是数字我从一个大数据集中的一小部分是子集,当我运行DCA排序时,我不断得到上面提到的错误......

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PCoA功能pcoa提取载体;方差百分比解释

我有一个由132个观测值和10个变量组成的数据集。这些变量都是绝对的。我试图看看我的观察如何聚集以及它们如何根据......

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如何使用省略ggplot2的箭头连接多个点

我使用纯素包来制作一些植被数据的时间序列。由于排序图常常混杂着许多数据点,我提取了第一个...的特征值。

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如何告诉R将函数应用于多个数据?

我一直在堆积这项工作很长一段时间,尝试了不同的方法,但无法成功。我想要的是将以下4个函数应用于30个不同的数据(data1,2,3,... data30)...

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如何在素食包中的bray nmds分析中添加椭圆

我使用纯素包绘制了点图,但我想圈出经过类似处理的物种。如图所示,3种颜色可用于3种处理。我也想圈出它们。这是我的代码。 ...

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如何解释cca素食主义者的输出

我使用纯素包在R中进行了规范的对应分析,但我发现输出很难理解。 triplot是可以理解的,但我得到的所有数字......

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如何在geom_point中使用cut时在ggplot中添加省略号

我正在尝试在ggplot中添加省略号(来自Pkg素食中的排序)基于使用geom_point切割成间隔/组以进行着色的值。我认为如果我提供一个...更容易

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从vegan包绘制ordiellipse函数到ggplot2中创建的NMDS图

我正在使用ggplot2来创建NMDS图,而不是正常的绘图函数。我想使用vegan包中的函数ordiellipse()在NMDS图中显示组。示例数据:...

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如何用bray-curtis相似度值绘制椭圆?

我想进行nMDS分析,我想在我的图形中添加代表bray-curtis相似度百分比的椭圆,但我不知道如何用R做这个,你可以做这种类型的图形......

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如何使用成对Bray-Curtis比较创建数据框?

我有一个大的植被数据集,想要使用vegan包中的vegdist函数计算Bray-Curtis距离。我有一个有370个配对站点的植被桌(deltaveg)(...

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PERMANOVA组间的多变量差异与方差同质性ANOVA不相似

我试着理解一个PERMANOVA假设,即多变量在群体之间传播与单变量ANOVA中的方差同质性相似,为此我制作一个R代码,我没有找到这个结果,为什么?...

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使用ggplot在MDS上绘制矢量图

我需要绘制一个带有载体的MDS,显示我的物种的丰度变化。我需要带有向量的图这是我的数据,每个物种和代码库(素食主义者)A丰富

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使用ggplot2定制素食pca图

我正在尝试在ggplot2中制作一些纯素rda结果的自定义图。我基本上修改了ggplot中绘制RDA(素食主义者)中的方向,因此我使用形状和颜色标签来...

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