vegan 相关问题

素食主义者是与R一起用于分析生态群落，特别是植被群落的一揽子计划。它具有分析生态多样性和社区多变量分析的工具（NMDS，pCCA，pRDA等）

R中的累积曲线（非素食主义者）

r for-loop matrix statistics vegan

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确定应用metaMDS进行的自动转换

[当autotransform = TRUE时，如何确定metaMDS应用于社区数据的转换类型？

vegan mds

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将行名保留在纯素软件包中

我正在使用素食主义者软件包中的vegdist（）来计算Morisita的相似性指数。我的数据的网站名称存储在第一列中。 TCR 3 0 0 0 MTF 0 1 2 0 UTZ 0 1 0 ...

r vegan

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如何将向量添加到R中的NMDS上？

我正在尝试研究盐度是否对无脊椎动物群落结构有影响。我设法制作了NMDS，但是每次尝试ordiplot或envfit时，都会出现数据类型不正确的错误。 ...

r ggplot2 vector vegan mds

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使用envfit（纯素）来计算物种得分

r regression vegan

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envfit结果如何创建？

我对如何从vegan包中的envfit（）函数重新创建结果有疑问。这是envfit（）与排序和环境向量一起使用的示例。 ...

r regression vegan

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“纯素”包装的累积曲线中标准偏差为0

dados

r curve vegan

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物种积累图的传说

如何向该图表添加标题？我尝试了以下命令，但我的图形消失了（纯素）数据（BCI）sp1

r graph legend vegan

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许多样本等于零的纯素矩阵的不相似性，纯素包装

vegan

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如何为mvabund的R stat公式解释嵌套抽样设计？

我有一个实验数据集，其中4个水箱中有16条鱼（64条鱼）。有两种处理-加热和控制以及四个水箱。在水箱1和2中进行加热，而在水箱3中进行控制...

r formula glm lm vegan

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如何使用“ how”功能进行不平衡的重复设计

r permutation vegan

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有没有一种方法可以将第一列定义为R vegan软件包中用于标本的站点名称，以避免错误？

在这里苦苦挣扎的业余程序员。在我的数据集中，我的第一列是站点名称，称它们为Tech 1到Tech8。其余各列分别分配给一个物种，二进制值为0或1s ...

r dataframe vegan

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R-在单轴折线图上操作尺寸

我正在使用Vegan包中的ordiplot函数为我的坐标数据绘制单轴图，代码如下：ordiplot（data，choices = 1）我只对第一个轴感兴趣，并且...

r fonts vegan cex

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绘制的环境向量与NMDS分数不匹配

我制作了NMDS图，并按照mytable站点的数据框= c（“站点A”，“站点B”，“站点C”，“站点D”，“站点E”，“站点F”， “站点G”，“站点H”，“站点I”，“站点J”，“站点K”，“站点L”，“站点...

r vegan

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我如何在素食主义者中自定义排序图

我有一个纯素食主义者的CCA，正在尝试绘制它，但只有一个非常基本的图，我想知道如何自定义该图-改变物种文字和箭头的颜色，点，变化...

r plot base vegan

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[尝试创建差异矩阵时如何处理数据集中的零？

我有一个简单的问题，今天我花了大约数百个小时的时间来进行谷歌搜索，但仍未解决。我希望这里的人能奇迹般地回答。我正在尝试制作bray curtis ...

r matrix vegan

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使用素食主义者的cca：无约束惯性

我使用具有7500个位点，9种和5个约束变量的纯素食主义者进行了CCA分析。结果为>调用：cca（sitspe = Yp，sitenv = Xp）惯性比例等级总计...

r vegan

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在R中的CCA绘图中添加绘图符号

我想生成规范对应分析（CCA）图，以显示环境参数对使用此代码的物种分布的影响：spe

r plot vegan

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素食主义者r软件包中的rda测试错误。变量未正确读取

我正在尝试使用纯素软件包执行简单的RDA，以使用以下数据框测试深度，流域和扇区对遗传种群结构的影响。数据文件。 “ ALL” ...

r vegan rda

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我如何访问由纯素函数envfit生成的整个模型的R平方值？

我正在通过使用无约束排序（PCA或NMDS），然后在素食主义者包装中使用具有envfit功能的环境向量拟合来分析某些微生物组数据。 envfit的输出...

r vegan

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