Bioconductor提供了分析和理解R语言中高通量基因组数据的工具。
我已经实现了一个R脚本，它对基因表达数据集执行批量修正。要进行批量修正，我首先需要通过Affy rma（）来标准化每个CEL文件中的数据...
结构（列表（AGI = c（“ATCG01240”，“ATCG01310”，“ATMG00070”），aox2_0h_1 = c（15.79105291,14.82652303,14.70630068），aox2_0h__2 = c（16.06494674,14.50610036,14.52189807），aox2_0h__3 = c（14.64596287 ,. ..
从ensembl_gene_id获取hgnc_symbol / gene_name
我有这个代码（来自这里）：library（'biomaRt'）mart
我似乎无法安装bioconductor包'monocle'进行单细胞RNA测序分析。我的R版本是3.4.3，Bioconductor是3.6。我一直收到此错误消息，并安装...
我正在尝试使用命令行输入的参数在RScript中运行DESeq。我使用optparse来解析用户参数，并试图将设计参数传递给DESeqDataSetFromMatrix（）...
我知道如何使用available.packages（）函数获取CRAN上所有可用软件包的列表（R的可用软件包的名称，并将CRAN上可用的所有软件包列入控制台）。但是怎么......
我已经安装了ggtree包v1.8.2并且我想使用getSubtree函数。但是我得到一个令人惊讶的错误:)：getSubtree（）中的错误：找不到函数“getSubtree”即使我......
我正在尝试为R安装data.table库，但是我无法让它工作。我尝试过使用CRAN和Bioconductor但是我一直收到一个错误，该包不适用于R 3.2.2： > ......
我想在flowSet上使用多个椭球门并绘制结果。我设法用每帧一个门绘制flowSet，但我无法正确构造filtersList对象。我明白了......
我已经快速浏览了其他帖子，但是找不到具有相同错误的帖子，即使有些似乎是一些常见的错误消息，所以如果我错过了以前的帖子，请道歉。我是 ...
我在我的ubuntu上安装了R（3.4.0）。我想使用EdgeR包。我尝试按照Bioconductor网站上提供的安装说明安装Bioconductor软件包。我用了 ...
我正在尝试使用他们网站上的代码将Bioconductor安装到R中。当我输入代码时（见下文）我收到一条错误消息，说某些软件包无法更新，安装...
无效的类“GRanges”对象：1：'x @ seqnames'与'x不平行
这个简单的代码：库（GenomicRanges）GRanges（c（“chr1”，“chr1”，“chr1”），c（109810200,109810201,109810544））失败，有一个相当神秘的异常：validObject（.Object）中的错误：.. 。
我试图在R中安装一个包，但无法解决以下错误。到底是怎么回事？ :(我正在运行Fedora 20，R 3.2 biocLite（“monocle”）BioC_mirror：http：//bioconductor.org ...
ComplexHeatMap - 在基础数据集中按顺序排序行，但不在最终热图中显示订单列
我想订购一个4 x热图的Complexheatmap，它按行顺序连接在一起，它包含在底层数据集的'Order'列中，但是我不希望订单列/数据可见...
我有一个xstringset对象一个长度为151674宽度的DNAStringSet实例seq名称[1] 253 ...
假设我有这个DNAStringSet（作为示例）dataset1一个长度为38874的DNAStringSet实例seq名称[1] 2617 GGC黄色[2] 4306 ACG蓝色[3] ...
如何在.Hub（“AnnotationHub”，hub，cache，proxy，localHub，...）中修复错误
我在R中使用REMP包来找到重复元素中的甲基化。我偶然发现函数initREMP，它给了我错误：remparcel
我正在使用ComplexHeatmap来绘制数据，但是，每当我开始划分矩阵以便更容易读取时，我的行/列的顺序似乎被洗牌。我想知道我是不是......
在闪亮的flexdashboard上加载RBioFormats时出错
我有一个使用flexdashboard的闪亮应用程序，我想继续前一段时间开始的开发过程。这个应用程序使用Bioconductor的RBioFormats包，现在我......