survival-analysis 相关问题

生存分析是对事件数据的审查时间的统计,由于观察的不确定组成员资格,标准回归和分类技术通常不适用于此。该名称源于生物系统,其中感兴趣的结果确实存在或死亡,但该概念同样适用于机械故障,经济事件或其他类型的预测。

生命线参考小组| Python 生存分析

有没有办法计算Python的Lifeline包中相对于指定组的危险比? 我现在拥有的是: 从生命线导入 CoxPHFitter 数据=KM_DF[["生存_蒂姆...

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导出编号。处于风险和 n.加权生存适应事件

我最近问为什么没有。加权 Kaplan-Meier 中的风险是不同的。 这是因为它是 treat == 1 和 treat == 0 中的权重之和。 数据和方法: 库(钴) # 假数据...

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根据事件状态绘制后续时间分布图

我想根据y轴上变量fustat中的事件状态创建x轴上变量futime的后续时间分布图。 数据(癌症,包=“生存”) 我在...

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未加权和加权 Kaplan-Meier 曲线中面临风险的人数不同

我不明白为什么未加权的卡普兰-迈耶曲线和加权后的风险人数不同。在加权 Cox 模型中,数字 n 可以...

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单变量分析中如何有效循环变量?

我编写了下面的代码来运行 cox 回归并将其输出到表格中。我想对许多变量运行单变量。你能帮我用一个循环来让它更快吗?变量有 Grade、DCIS、L...

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如何从 scikit-survival 中的 CoxPHSurvivalAnalysis 获取概率密度函数?

我正在使用 sksurv.linear_model.CoxPHSurvivalAnalysis 来拟合 cox ph 回归,我想恢复密度函数 f(t)。 sksurv 类有预测生存函数的方法...

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R 中的 Jackknife 获取区间估计值

我有一个关于如何使用引导程序包使用折刀的问题。我想获得折刀法的区间估计。 我尝试运行下面的代码,但没有结果

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如何从riskRegression::FGR()次分布竞争风险模型对象中获得预测和观察到的风险估计?

我想从事件风险回归::FGR()竞争风险模型对象中提取观察到的和预测的估计。 下面是一些模拟数据: 图书馆(模拟研究) 库(数据.表) 图书馆(

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使用survRM2包中的rmst2函数时如何解决“Object 'Note' not find error”?

我的目的是比较安德森数据集中两个治疗组之间的限制平均生存时间 安德森数据集 这是我的数据框的结构: 'data.frame':42 个 obs。共 5 个

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计算 Ctree 对象后绘制 Kaplan Meier 曲线

在我的博士学位中,为了确定 COVID-19 死亡率的预测因素,我使用 Ctree 计算了分类生存树。这是使用的代码: 图书馆(生存) 图书馆(幸存者) 图书馆(党) 我...

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如何用 3 个图制作 Kaplan-Meier 生存曲线

在此处输入图像描述我对 R studio 非常陌生,目前正在学习如何制作 Kaplan-Meier 生存曲线。 我正在使用 TCGA-LIHC 队列来可视化 3 种亚型的生存曲线(s...

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如何使用 lapply 和并行化优化这个 for 循环以运行得更快?

我正在使用生存分析技术进行中介分析。这需要使用 for 循环进行引导。我的挑战是这个模型需要很长时间才能运行,我愿意

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使用 crrSC 包中的 crrs() 从 R 中的分层细灰色模型获取次分布风险比和 95% 置信区间

我正在使用 crrSC 包中的 crrs() 函数在 R 中运行分层细灰色模型。当使用 cmprsk 中的 crr() 函数运行 Fine-Gray 模型时,可以获得 exp(coef) 和置信度

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根据日期列将 R 中的数据帧拆分为每个 ID 的多行

我在 R 中有一个数据框,如下所示: 图书馆(dplyr) 库(润滑) 图书馆(tidyr) 设置.种子(123) # 创建数据集 行数 <- 1000 fixed_start_date <- as.Date("2021-12-27")

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如何在 R 中的累积发生率图上绘制中线,并包括风险表/累积事件表?

这是我想要执行的代码的可重复示例: 图书馆(生存) 图书馆(幸存者) 公里.适合 <- survfit(Surv(rfstime, status) ~ 1, data = gbsg) ggsurvplot(km.fit, fun = functio...

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ggsurvplot 扩展限制未对齐图和表?

我正在使用 ggsurvplot 生成一个带有风险数字表的 kaplan-meir。我希望我的轴扩展,如图所示。然而,这意味着表格与PL不对齐...

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改变 ggsurvplot 中自定义表格的美观?

我使用下面的代码向 R 中的 ggsurvplot 添加一个报告中位生存率的自定义表。正如你所看到的,表格显示为灰色,有点像 ggplot 中的them_gray()主题。一个人如何改变...

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KeyError:“只有系列名称可用作系列数据类型映射中的键。”使用 CoxPHFitter 时

当我尝试拟合 Coxph 模型时收到以下错误 第5797章 5798 结果.append( -> 5799 ...

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根据顺序数据集中的标签创建间隔块

我正在尝试使用我已有的每月数据集构建生存分析数据集。 我当前使用 Pandas 的 Python 代码是这样的(我知道这段代码还不完美,但是......

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根据 pandas 中的顺序数据集中的标签创建间隔块

所以我尝试使用我已有的每月数据集构建生存分析数据集。 我当前使用 Pandas 的 Python 代码是这样的(我知道这段代码还不完美......

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